109 bài báo khoa học thuộc lĩnh vực Hóa – Công nghệ thực phẩm, có 42 bài báo tạp chí trong nước; 67 bài báo tạp chí quốc tế (trong 5 năm liền kề có 7 bài báo thuộc WoS/Scopus với 2 bài là tác giả chính; có 11 bài báo khoa học trong nước được tính điểm từ 0,75 đ là tác giả chính)

Tổng số đã công bố: . Giáo sư, Tiến sĩ Hà Thanh Toàn cũng là tác giả của nhiều sách chuyên khảo và giáo trình, bao gồm 1 sách chuyên khảo và 4 giáo trình.

Hướng dẫn thành công 9 nghiên cứu sinh bảo vệ luận án Tiến sĩ. Ông còn có một bằng sáng chế được cấp tại Hoa Kỳ vào năm 2005.